中國科學院合肥物質(zhì)科學研究院（以下簡稱合肥研究院）是中國科學院在安徽設(shè)立的一個綜合性科研基地和人才培養(yǎng)基地，成立于2001年11月。合肥研究院位于合肥市西郊風景秀麗的董鋪島上，面積2.65平方公里。島上三面環(huán)水，綠樹成蔭。江澤民總書記1998年蒞臨視察時對這里的科研環(huán)境給予了很高評價，并欣然題詞“科學島”，由此科學島成為合肥研究院的別名。 　

　　合肥研究院下屬10個研究所。在安徽光學精密機械研究所、等離子體物理研究所、固體物理研究所、合肥智能機械研究所4個老牌研究所基礎(chǔ)上，自2006年起至2015年，陸續(xù)成立了強磁場科學中心、先進制造技術(shù)研究所、醫(yī)學物理與技術(shù)中心、技術(shù)生物與農(nóng)業(yè)工程研究所、核能安全技術(shù)研究所、應(yīng)用技術(shù)研究所。截至2016年7月，在職職工2500余人，其中專業(yè)技術(shù)人員2000余人，高端科技專家如兩院院士、萬人計劃、千人計劃、杰出青年基金獲得者、“973”首席科學家、“863”計劃專家、關(guān)鍵技術(shù)人才等300多人。設(shè)有5個博士后站點，在站博士后73人。設(shè)有12個博士點和25個碩士點，在讀研究生1600余人。自2014年起，合肥研究院招收的研究生全部擁有中國科學技術(shù)大學學籍。 　

　　合肥研究院長期承擔著眾多國家科研任務(wù)，主要研究領(lǐng)域涉及能源、環(huán)境、生物、材料、信息、國防，主要學科方向有磁約束核聚變科學與技術(shù)、先進核能與核安全技術(shù)、大氣環(huán)境探測與監(jiān)測技術(shù)、強磁場科學與技術(shù)、特殊環(huán)境服役材料、機器人與智能裝備、現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)、醫(yī)學物理與技術(shù)以及國防戰(zhàn)略高技術(shù)等。2015年獲得國家自然科學基金項目169項，居全國科研機構(gòu)第一位。 　

　　隨著科研事業(yè)的發(fā)展，合肥研究院建成了20多個裝備優(yōu)良的國家或省部級重點實驗室、研究中心和10多個大型技術(shù)物理實驗平臺，包括EAST核聚變實驗裝置、EAST輔助加熱系統(tǒng)、穩(wěn)態(tài)強磁場等三個大科學工程，辦有《Plasma Science and Technology》等5個學術(shù)刊物，是中國主要的核聚變研究基地之一，是世界實驗室在我國設(shè)立的核聚變研究中心，也是中國科學院重要的科技創(chuàng)新基地。 

　　2005-2015年，合肥研究院獲得國家科技獎共19項，其中國家科技進步獎-創(chuàng)新團隊獎1項，國家科技進步一等獎4項、二等獎6項，國家自然科學二等獎3項，國家技術(shù)發(fā)明二等獎2項，國家國際科技合作獎3項；獲得安徽省科學技術(shù)獎28項。2005-2014年發(fā)表的SCI收錄論文累計被引用4117篇，在全國科研機構(gòu)排名第7位，Nature Index 2015 綜合指數(shù)位列全國科研機構(gòu)第8位，SCI論文數(shù)量在全國科研機構(gòu)中連續(xù)多年排名第3位。2015年發(fā)明專利申請量在全國科研機構(gòu)中排名第四位。 　

　　2014年6月，合肥研究院成立了中科院合肥技術(shù)創(chuàng)新工程院，專門承擔科技成果產(chǎn)業(yè)化工作。以此為中心，建設(shè)了銅陵皖江新興產(chǎn)業(yè)技術(shù)發(fā)展中心（輻射皖南）和淮南新能源中心（帶動皖北），形成了“一主兩翼”的院地合作格局，并在多個縣區(qū)設(shè)立項目示范基地，和企業(yè)聯(lián)合成立了安徽省新能源汽車等8個產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新聯(lián)盟，構(gòu)建了服務(wù)當?shù)亟?jīng)濟發(fā)展的科技成果轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化體系。合肥研究院設(shè)有資產(chǎn)管理公司，直接投資或與社會資源合作成立控股參股公司36家。